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抗体CDR区域的氨基酸序列是决定抗体与抗原结合特异性的关键,快速精确的分析其完整序列非常重要。 钟鼎生物在抗体测序方面拥有极其丰富的经验,可以完成不同宿主来源(小鼠、大鼠、兔、羊驼等)、不同重链(IgG、IgM等)轻链(Kappa、Lambda)亚型以及多细胞类型的抗体测序工作。 同时,我们还拥有完备的下游高通量重组抗体表达平台,实现实验无缝对接,让项目一体化、流程均一化成为可能。

技术概述

De Novo测序(从头测序)是一种不依赖任何已知数据库或基因模板,直接通过高分辨率质谱(LC-MS/MS)对抗体蛋白的酶解肽段进行MS/MS碎片分析,并借助先进的生物信息学算法从碎片峰图中逐步推断氨基酸序列,最终拼接出完整的抗体轻重链序列的技术。

当面对“仅存蛋白、基因序列丢失”的珍贵杂交瘤细胞株、临床来源的天然抗体、免疫动物体内的多克隆抗体时,传统的依赖mRNA或参考数据库的测序方式往往束手无策。钟鼎生物的从头测序平台,正是为破解这类“无据可查”的困局而生。

为什么选择钟鼎生物?

✅ 全序列100%覆盖

选用5种以上的蛋白酶进行酶切,利用不同酶切肽段之间的互补性,实现抗体轻链重链100%全序列的拼接,每段CDR序列至少被鉴定到10次,充分保证测序结果的精度。

✅ 高精度质谱检测

采用高精度Orbitrap Elite等先进质谱仪,突破传统测序技术分辨率低的限制,在速度、结果可信度、准确性方面均有极大程度提升。

✅ 修饰识别能力

同步解析糖基化、氧化、脱酰胺、焦谷氨酸环化等翻译后修饰,还原抗体真实构象,满足IND/BLA申报材料要求。

✅ 可验证、可转化

测序获得的序列可直接在钟鼎内部进行重组表达和活性验证,这种“测序即表达”的一站式能力,是纯测序服务商难以提供的独特优势。

✅ 多物种多亚型覆盖

可对小鼠、大鼠、兔、羊驼、人源等多种宿主的IgG、IgM等不同亚型抗体进行测序,亦支持荧光偶联抗体、固定化抗体等特殊类型样本。

✅ 丰富的项目经验

累计完成超过4,471项抗体制备项目,拥有成熟的抗体表达与验证体系。累计服务全球9,800多名研究者,协助发表高水平论文2,000余篇。

服务详情

服务项目 服务内容 交付标准 周期 备注
抗体/蛋白从头测序 A. 样品多重酶切
B. 质谱分析
C. LC-MS/MS
D. 数据分析及序列拼接
① 完整的抗体测序报告
② 含有抗体片段的质粒
③ 原始质谱数据(可选)
④ CDR区标识及修饰位点注释
2-3个月
测序+重组抗体表达
(可选)
A. 样品多重酶切
B. 质谱分析
C. LC-MS/MS
D. 数据分析及序列拼接
E. 重组抗体表达
① 完整的抗体测序报告
② 含有抗体片段的质粒
③ 纯化后的重组抗体蛋白
④ 活性验证数据
3-4个月 推荐选择,一站式验证
📋 样品要求:建议提供≥20 µg高纯度抗体蛋白(≥95%),或清晰的SDS-PAGE条带。同时支持杂交瘤细胞株样本的测序服务,可直接从细胞株出发完成全套分析。

应用场景

老抗体重建与复现

实验室保存的杂交瘤细胞株或纯化抗体,原始基因序列已丢失?De Novo测序直接从蛋白出发,还原完整序列,实现功能性“复刻”与专利保护。

💊 临床样本与天然抗体解析

无法提取mRNA的临床血清样本或动物免疫抗体,De Novo测序是唯一适用的结构解析方式,为个性化治疗抗体筛选提供序列信息基础。

📑 抗体药一致性评价与仿制

对不同表达系统或不同工艺批次下的抗体药物,进行完整序列比对与翻译后修饰鉴定,满足IND/BLA申报材料要求。

🔍 商业抗体验证与质量控制

分析不同厂商生产的相同标号抗体是否存在序列差异、突变或修饰变异,确保实验的可重复性和数据可靠性。

多克隆抗体关键序列挖掘

从动物免疫血清中,通过De Novo测序挖掘高亲和力抗体的核心CDR序列,用于重组筛选与亲和力成熟。

⚖️ 抗体专利规避与创新设计

基于测序结果识别已授权抗体药物的结构特征,设计具有序列差异而功能相近的新型抗体,辅助新药研发中的知识产权策略规划。

实验流程

1
样品制备与质控

抗体纯度≥95%,浓度测定与SDS-PAGE验证

2
多酶组合酶解

5种以上蛋白酶平行酶切,生成重叠肽段库

3
LC-MS/MS质谱采集

高分辨率Orbitrap质谱仪采集MS/MS谱图

4
生物信息学分析

De Novo算法解析谱图,序列拼接与校验

5
报告交付与验证

完整测序报告+重组表达验证(可选)

🔒 保密性说明

钟鼎生物严格遵守保密协议,对所有客户提供的样品信息、测序数据及分析结果进行严格保密管理。未经客户书面许可,绝不向任何第三方透露相关信息。我们可根据客户需求签署正式的保密协议(NDA),确保您的知识产权安全。

常见问题

Q1:抗体从头测序能否区分亮氨酸(Leu)和异亮氨酸(Ile)?

亮氨酸与异亮氨酸具有相同的分子量(131.17 Da),因此常规质谱法无法将两者区分开。在常规测序结果中,通常以“Leu/Ile”或“L/I”表示。如需明确区分,建议结合DNA测序或采用WILD等特殊质谱技术进行补充分析。

Q2:多克隆抗体是否可以进行从头测序?

目前,传统的从头测序技术主要适用于单克隆抗体。多克隆抗体因含有多种不同序列的抗体分子,直接解析难度较大。但近年来,随着PolySeq.AI等新方法的发展,多抗测序已逐步成为可能。钟鼎生物正持续关注并推进该领域技术,欢迎就具体项目进行可行性咨询。

Q3:测序结果的准确性能达到多少?

钟鼎生物通过多酶组合酶解和高频覆盖(每段CDR序列至少被鉴定到10次),确保抗体轻重链序列100%覆盖,序列准确性可达99%以上。对于CDR区域,我们采用多重验证机制,确保关键功能区域的序列精准无误。

Q4:是否可以直接送杂交瘤细胞株进行测序?

可以。我们支持从杂交瘤细胞株直接起始,完成抗体纯化、测序以及后续重组表达的一站式服务。建议提供至少1×10⁶个活细胞或冻存的细胞株样本。

案例

1.全序列100%覆盖

我们会选用5种以上的蛋白酶对抗体进行酶切,利用不同酶切肽段之间的互补性,实现抗体轻链重链100%全序列的拼接,每段CDR序列至少被鉴定到10次。通过这样高频度的覆盖,可以充分保证测序结果的精度。

100%全序列覆盖

2.高精度

采用高精度的Orbitrap Elite测序仪,其可以突破传统测序技术带来的分辨率低的限制,在速度、结果的可信度、准确性方面均有极大程度的提升。

高精度

实力背书

5,000m²

现代化实验基地,含独立的分子、蛋白、免疫学实验室及万级细胞房、液相质谱分析实验室

200+

专业技术人员,具备二十年以上生命科学项目研发经验

4,471+

累计完成抗体制备项目

2,000+

协助发表高水平论文,累计影响因子10,000+

相关服务

重组抗体表达服务

高通量重组抗体表达平台,支持CHO、HEK293等多种表达系统。

杂交瘤抗体制备

从抗原设计到杂交瘤筛选的全流程单克隆抗体制备服务。

蛋白组定性分析

N端测序、C端测序、肽段序列测定、分子量测定等全套蛋白分析服务。