抗体CDR区域的氨基酸序列是决定抗体与抗原结合特异性的关键,快速精确的分析其完整序列非常重要。 钟鼎生物在抗体测序方面拥有极其丰富的经验,可以完成不同宿主来源(小鼠、大鼠、兔、羊驼等)、不同重链(IgG、IgM等)轻链(Kappa、Lambda)亚型以及多细胞类型的抗体测序工作。 同时,我们还拥有完备的下游高通量重组抗体表达平台,实现实验无缝对接,让项目一体化、流程均一化成为可能。
De Novo测序(从头测序)是一种不依赖任何已知数据库或基因模板,直接通过高分辨率质谱(LC-MS/MS)对抗体蛋白的酶解肽段进行MS/MS碎片分析,并借助先进的生物信息学算法从碎片峰图中逐步推断氨基酸序列,最终拼接出完整的抗体轻重链序列的技术。
当面对“仅存蛋白、基因序列丢失”的珍贵杂交瘤细胞株、临床来源的天然抗体、免疫动物体内的多克隆抗体时,传统的依赖mRNA或参考数据库的测序方式往往束手无策。钟鼎生物的从头测序平台,正是为破解这类“无据可查”的困局而生。
选用5种以上的蛋白酶进行酶切,利用不同酶切肽段之间的互补性,实现抗体轻链重链100%全序列的拼接,每段CDR序列至少被鉴定到10次,充分保证测序结果的精度。
采用高精度Orbitrap Elite等先进质谱仪,突破传统测序技术分辨率低的限制,在速度、结果可信度、准确性方面均有极大程度提升。
同步解析糖基化、氧化、脱酰胺、焦谷氨酸环化等翻译后修饰,还原抗体真实构象,满足IND/BLA申报材料要求。
测序获得的序列可直接在钟鼎内部进行重组表达和活性验证,这种“测序即表达”的一站式能力,是纯测序服务商难以提供的独特优势。
可对小鼠、大鼠、兔、羊驼、人源等多种宿主的IgG、IgM等不同亚型抗体进行测序,亦支持荧光偶联抗体、固定化抗体等特殊类型样本。
累计完成超过4,471项抗体制备项目,拥有成熟的抗体表达与验证体系。累计服务全球9,800多名研究者,协助发表高水平论文2,000余篇。
| 服务项目 | 服务内容 | 交付标准 | 周期 | 备注 |
|---|---|---|---|---|
| 抗体/蛋白从头测序 | A. 样品多重酶切 B. 质谱分析 C. LC-MS/MS D. 数据分析及序列拼接 |
① 完整的抗体测序报告 ② 含有抗体片段的质粒 ③ 原始质谱数据(可选) ④ CDR区标识及修饰位点注释 |
2-3个月 | — |
| 测序+重组抗体表达 (可选) |
A. 样品多重酶切 B. 质谱分析 C. LC-MS/MS D. 数据分析及序列拼接 E. 重组抗体表达 |
① 完整的抗体测序报告 ② 含有抗体片段的质粒 ③ 纯化后的重组抗体蛋白 ④ 活性验证数据 |
3-4个月 | 推荐选择,一站式验证 |
实验室保存的杂交瘤细胞株或纯化抗体,原始基因序列已丢失?De Novo测序直接从蛋白出发,还原完整序列,实现功能性“复刻”与专利保护。
无法提取mRNA的临床血清样本或动物免疫抗体,De Novo测序是唯一适用的结构解析方式,为个性化治疗抗体筛选提供序列信息基础。
对不同表达系统或不同工艺批次下的抗体药物,进行完整序列比对与翻译后修饰鉴定,满足IND/BLA申报材料要求。
分析不同厂商生产的相同标号抗体是否存在序列差异、突变或修饰变异,确保实验的可重复性和数据可靠性。
从动物免疫血清中,通过De Novo测序挖掘高亲和力抗体的核心CDR序列,用于重组筛选与亲和力成熟。
基于测序结果识别已授权抗体药物的结构特征,设计具有序列差异而功能相近的新型抗体,辅助新药研发中的知识产权策略规划。
抗体纯度≥95%,浓度测定与SDS-PAGE验证
5种以上蛋白酶平行酶切,生成重叠肽段库
高分辨率Orbitrap质谱仪采集MS/MS谱图
De Novo算法解析谱图,序列拼接与校验
完整测序报告+重组表达验证(可选)
钟鼎生物严格遵守保密协议,对所有客户提供的样品信息、测序数据及分析结果进行严格保密管理。未经客户书面许可,绝不向任何第三方透露相关信息。我们可根据客户需求签署正式的保密协议(NDA),确保您的知识产权安全。
亮氨酸与异亮氨酸具有相同的分子量(131.17 Da),因此常规质谱法无法将两者区分开。在常规测序结果中,通常以“Leu/Ile”或“L/I”表示。如需明确区分,建议结合DNA测序或采用WILD等特殊质谱技术进行补充分析。
目前,传统的从头测序技术主要适用于单克隆抗体。多克隆抗体因含有多种不同序列的抗体分子,直接解析难度较大。但近年来,随着PolySeq.AI等新方法的发展,多抗测序已逐步成为可能。钟鼎生物正持续关注并推进该领域技术,欢迎就具体项目进行可行性咨询。
钟鼎生物通过多酶组合酶解和高频覆盖(每段CDR序列至少被鉴定到10次),确保抗体轻重链序列100%覆盖,序列准确性可达99%以上。对于CDR区域,我们采用多重验证机制,确保关键功能区域的序列精准无误。
可以。我们支持从杂交瘤细胞株直接起始,完成抗体纯化、测序以及后续重组表达的一站式服务。建议提供至少1×10⁶个活细胞或冻存的细胞株样本。
1.全序列100%覆盖
我们会选用5种以上的蛋白酶对抗体进行酶切,利用不同酶切肽段之间的互补性,实现抗体轻链重链100%全序列的拼接,每段CDR序列至少被鉴定到10次。通过这样高频度的覆盖,可以充分保证测序结果的精度。
2.高精度
采用高精度的Orbitrap Elite测序仪,其可以突破传统测序技术带来的分辨率低的限制,在速度、结果的可信度、准确性方面均有极大程度的提升。
现代化实验基地,含独立的分子、蛋白、免疫学实验室及万级细胞房、液相质谱分析实验室
专业技术人员,具备二十年以上生命科学项目研发经验
累计完成抗体制备项目
协助发表高水平论文,累计影响因子10,000+