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三七 (Panax notoginseng) 酵母双杂交文库

完成日期:2024/10/31 物种:三七 (Panax notoginseng) 授权状态:需客户授权
知识产权与授权声明
本文库由钟鼎生物基于客户样本构建,版权及相关知识产权归原始建库客户所有。目前平台展示该文库信息仅为促进科研合作与资源共享。任何单位或个人如需使用本文库进行筛选或商业应用,须通过钟鼎生物与原建库客户协商并签署授权协议。如有合作意向,请联系我们获取授权支持。
1.04×10⁷
次级文库库容 (CFU)
满足下游筛选需求
100%
重组率
24/24克隆均为阳性插入
>1000 bp
平均插入片段长度
覆盖全长cDNA范围 0.1–4 kb
100%
物种来源正确率
测序验证均为三七来源

文库质量总览

基于 Invitrogen Gateway® 技术构建,无PCR偏好性,完整保留转录组信息

✅ 文库构建结论:本实验以三七(Panax notoginseng)为起始材料,成功构建核体系酵母双杂交文库。经全面质控:初级文库库容 1.44×10⁷ CFU,重组率100%;次级文库库容 1.04×10⁷ CFU,重组率100%;电泳检测平均插入片段长度 >1000 bp;随机挑取克隆进行菌落PCR及Sanger测序验证,物种来源均为三七,无外源污染,插入片段序列不重复。各项指标均达到高质量文库标准,可用于下游酵母双杂交筛选及药用植物功能基因组学研究。

适用方向:三七皂苷(人参皂苷Rg1、Rb1等)生物合成途径调控、根茎发育与次生代谢调控、抗病(根腐病等)分子机制、环境胁迫响应信号通路、转录因子互作网络解析等。

关键实验步骤与质控数据

完整流程包括 Total RNA提取 → mRNA分离 → ds cDNA合成 → BP重组 → LR重组 → 文库质控(含Sanger测序)

Total RNA 提取 & mRNA 分离

Total RNA 电泳图
图1 Total RNA 电泳图 – 28S/18S条带清晰,完整性良好
mRNA 分离结果
图2 mRNA分离结果 – 弥散条带最亮区>1000bp,质量合格

采用Trizol法提取Total RNA总量>300μg,经GenElute™ Direct mRNA Miniprep Kit纯化获得高质量mRNA。

ds cDNA 合成 & 分级分离

双链cDNA电泳
图3 双链cDNA电泳 – 弥散条带集中于0.1~4 kb,覆盖全长信息

采用SMARTer技术避免PCR扩增偏差,cDNA经分级柱收集,确保大片段富集。

初级文库库容 & 重组率鉴定

初级文库平板
图4 初级文库库容量平板 (Kan抗性) – 单克隆计数1800/稀释板,计算库容1.44×10⁷
初级文库重组率电泳
图5 初级文库重组率电泳 – 24/24克隆均有插入片段,重组率100%,平均片段>1000bp

次级文库库容 & 重组率鉴定

次级文库平板
图6 次级文库库容量平板 (Amp抗性) – 单克隆计数1300/稀释板,库容1.04×10⁷
次级文库重组率
图7 次级文库重组率 – 24/24阳性,重组率100%,插入片段>1000bp

随机克隆测序验证(物种来源 & 插入真实性)

初级文库测序Blast结果
图8 初级文库随机克隆测序 – 经Blast比对,6个克隆100%匹配人参属(Panax),无污染
次级文库测序验证
图9 次级文库随机克隆测序 – 6个克隆均为三七来源,插入片段平均>1000bp,序列不重复

通过Sanger测序及NCBI BLAST分析,进一步证实文库具有高度的物种特异性和序列多样性,可用于筛选真实互作蛋白。

完整质控参数

依据严格质控标准,每一份文库均提供可追溯数据

质控项目初级文库 (pDONR222)次级文库 (pGADT7-DEST)
库容量 (CFU)1.44 × 10⁷1.04 × 10⁷
重组率100% (24/24)100% (24/24)
平均插入片段长度>1000 bp>1000 bp
插入片段范围0.1 – 4 kb (弥散分布)
随机测序正确率6/6 均为三七来源,无空载或污染
转化方法电转化 DH10B 感受态
载体抗性KanamycinAmpicillin
适用筛选方法共转化 / mating 筛选

※ 所有质控数据均存档于原始实验报告(订单号ZD2024L023799-1)中,可提供完整电泳图谱及测序原始文件。

钟鼎生物特色文库平台优势

稀有资源 + 知识产权合规化运营

严格质控体系

每批文库均进行库容、重组率、插入片段、随机测序四重质控,确保交付即用。

知识产权合规合作

特色文库均需通过授权机制使用,平台提供对接服务。

一站式互作服务

从文库筛选到点对点验证(Co-IP、Pull-down、BiFC)无缝衔接。

丰富物种经验

已完成药用植物、木本经济植物、珍稀濒危物种等特色文库200+,成功率>99%。

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