Gateway® 技术 · 核体系酵母双杂交文库

棉花 (陆地棉) 酵母双杂交文库

完成日期:2023/09/18 物种:Gossypium (棉花)
1.44×10⁷
次级文库库容 (CFU)
远超常规筛选需求 (≥1×10⁶)
100%
重组率
24/24克隆均为阳性插入
>1000 bp
平均插入片段长度
覆盖全长cDNA范围 0.1–4 kb
100%
物种来源正确率
6/6 测序比对均为棉花

文库质量总览

基于 Invitrogen Gateway® 技术构建,无PCR偏好性,完整保留转录组信息

✅ 文库构建结论:本实验以棉花根、茎、叶混合样本为起始材料,成功构建核体 系酵母双杂交文库。经全面质控:初级文库库容 1.2×10⁷ CFU,次级文库库容 1.44×10⁷ CFU;初级与次级文库重组率均为 100%;电泳检测平均插入片段长度 >1000 bp;随机挑取克隆测序,物种来源均为棉花(Gossypium),无外源污 染。各项指标均达到高质量文库标准,可放心用于下游酵母双杂交筛选及互作蛋白鉴定。

适用方向:蛋白互作网络筛选、信号转导机制、作物抗逆/发 育调控因子互作研究。

关键实验步骤与质控数据

完整流程包括 RNA提取 → mRNA分离 → ds cDNA合成 → BP重组建初级库 → LR重组建次级库

Total RNA & mRNA 质检

Total RNA 电泳图
图1 Total RNA 电泳图 (M: Marker 2000, 1-12: RNA样品)
28S/18S清晰,完整性良好
mRNA 分离结果
图2 mRNA 分离结果 – 弥散条带最亮区>1000bp,质量合格

提取总量>300 μg Total RNA,mRNA富集效果理想,满足建库要求。

ds cDNA 合成 & 分级分离

双链cDNA电泳
图3 双链cDNA电泳 – 弥散条带集中于0.1~4 kb,覆盖全长信息

采用SMARTer技术避免PCR扩增偏差,cDNA经分级柱收集,确保大片段富集。

初级文库库容 & 重组率鉴定

初级文库库容量平板 (Kan抗性)
图4 初级文库库容量平板 (Kan抗性) – 单克隆计数>1500/稀释板,计算库容1.2×10⁷
初级文库重组率电泳
图5 初级文库重组率电泳 – 24/24克隆均插入片段,重组率100%,平均片段>1000bp

次级文库库容 & 重组率鉴定

次级文库库容量平板 (Amp抗性)
图7 次级文库库容量平板 (Amp抗性) – 库容1.44×10⁷ CFU
次级文库重组率
图8 次级文库重组率 – 24/24阳性,100%重组,插入片段>1000bp

随机克隆测序验证(物种来源 & 插入真实性)

初级文库测序Blast结果
图6 初级文库测序Blast结果 – 6个克隆均为Gossypium来源
次级文库测序Blast结果
图9 次级文库测序Blast结果 – 与棉花基因组高度匹配,无污染

通过随机挑取克隆进行Sanger测序,进一步证实文库具有高度的物种特异性和序列多 样性,可用于筛选真实互作蛋白。

完整质控参数

依据严格质控标准,每一份文库均提供可追溯数据

质控项目初级文库 (pDONR222)次级文库 (pGADT7-DEST)
库容量 (CFU)1.2 × 10⁷1.44 × 10⁷
重组率100% (24/24)100% (24/24)
平均插入片段长度>1000 bp>1000 bp
插入片段范围0.1 – 4 kb (弥散分布)
随机测序正确率6/6 均为棉花来源,无空载或污染
转化方法电转化 DH10B 感受态
载体抗性KanamycinAmpicillin
适用筛选方法共转化 / mating 筛选

※ 所有质控数据均存档于原始实验报告中,可提供完整电泳图谱及测序原始文件。

钟鼎生物文库平台优势

高质量保证 + 知识产权合规化运营

严格质控体系

每一批文库均进行库容、重组率、插入片段、随机测序四重质控,确保交付即用。

知识产权合规合作

所有文库均获得原始建库客户授权,提供分成合作模式,合法共享,尊重创新。

一站式互作服务

从文库筛选、点对点验证(酵母回转、Co-IP、Pull-down、BiFC)到下游功能分析,无缝衔接。

丰富物种经验

已完成棉花、水稻、玉米、大豆、拟南芥、人、对虾等200+物种文库,成功率>99% 。

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