甘草查尔酮C如何双管齐下破解胃癌耐药?

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小分子pull-down助力研究索托拉西布肺毒性新机制

项目 信息
文献标题 Licochalcone C suppresses gastric cancer progression and enhances 5-FU chemosensitivity by targeting RAC3-mediated PI3K-AKT-mTOR signaling
文献译名 甘草查尔酮C通过靶向RAC3介导的PI3K-AKT-mTOR信号抑制胃癌进展并增强5-氟尿嘧啶化疗敏感性
期刊名称 Phytomedicine
影响因子 11.3
第一作者 王清水
通讯作者 林尧、黄铭涵、薛芳沁
单位 福建中医药大学


研究背景


胃癌是全球第五大常见恶性肿瘤和第三大癌症死因。系统化疗是晚期胃癌的主要治疗手段,其中5-氟尿嘧啶(5-FU)是一线方案的核心药物,但耐药问题严重制约疗效。天然产物是抗肿瘤药物的重要来源,甘草中的查尔酮类化合物(如甘草查尔酮A、B、C等)已被报道具有广谱抗癌活性。其中,甘草查尔酮A可通过抑制药物外排泵(P-gp、BCRP)增强化疗敏感性,并在胃癌中与5-FU协同增效。然而,结构相似的甘草查尔酮C在胃癌中的抗肿瘤作用及其对5-FU敏感性的影响尚不清楚。本研究旨在系统评估甘草查尔酮C的抗胃癌活性及其增敏5-FU的潜力,并阐明其分子靶点和信号通路,为克服胃癌化疗耐药提供新策略。钟鼎生物协助完成了生物素标记甘草查尔酮C pull-down联合质谱的工作,为该项目提供了充分的技术支持。

作者研究的核心是揭示了天然产物甘草查尔酮C通过靶向RAC3蛋白,从“抑制药物外排(下调P-gp)”和“阻滞细胞周期(诱导G1期阻滞)”两个层面协同增强胃癌对5-FU的化疗敏感性。而小分子pull-down实验在其中起到了“一锤定音”的决定性作用——它从成千上万种蛋白中直接“钓”出了RAC3,证实了甘草查尔酮C与RAC3存在直接物理结合,从而将整个机制链条的起点牢牢锚定在RAC3这个靶点上,为后续所有信号通路和增敏效应的研究奠定根基。



研究思路


1.功能表型分析与通路定位

Licochalcone C处理胃癌细胞系(AGS、MKN45)及患者来源类器官,CCK-8、克隆形成、Transwell迁移/侵袭实验证实其显著抑制增殖、迁移和侵袭;RNA-seq结合Western blot及流式细胞术揭示其诱导G1期阻滞(Cyclin D1/CDK2/CDK4下调)并抑制PI3K-AKT-mTOR磷酸化。

2.靶点发现与验证—小分子pull-down + 质谱及功能救援

生物素标记Licochalcone C pull-down联合质谱鉴定RAC3为直接结合靶点,分子对接、CETSA、Co-IP验证其物理结合,G-LISA证实其抑制RAC3 GTPase活性但不改变表达量;shRNA敲低RAC3表型复制Licochalcone C的抗肿瘤效应,RAC3过表达逆转上述效应,证实RAC3为其关键功能性靶点。

3.增敏机制解析与临床转化验证

① RAC3敲低或Licochalcone C处理下调P-gp表达(Western blot),降低5-FU外排;
② 抑制PI3K-AKT-mTOR通路诱导G1期阻滞——双通路协同增强5-FU敏感性(IC50显著下降);
③TCGA及GEO数据库联合IHC(80例临床样本)验证RAC3在胃癌中高表达且与不良预后及化疗复发正相关;④裸鼠移植瘤模型证实Licochalcone C联合5-FU体内抑瘤效果最强(体积/重量最小、Ki67最低)。



主要研究发现


1. 甘草查尔酮C在体外和患者来源类器官中抑制胃癌细胞增殖、迁移和侵袭

CCK-8实验显示,甘草查尔酮C剂量依赖性地降低AGS和MKN45细胞活力,IC50分别为18.02 μM和11.6 μM(图1A-B)。克隆形成实验表明其显著减少集落数量(图1E),Transwell迁移和侵袭实验证实其抑制细胞迁移和侵袭能力(图1F-I)。在患者来源的胃癌类器官中,甘草查尔酮C同样剂量依赖性地抑制类器官生长,IC50值明确(图1J-M),代表性图像显示类器官尺寸显著缩小(图1N)。上述结果表明甘草查尔酮C具有广谱抗胃癌活性。

甘草查尔酮C对胃癌细胞生长、运动和类器官的影响

图1.甘草查尔酮C对胃癌细胞生长、运动和类器官的影响。


2. 转录组分析揭示甘草查尔酮C诱导G1期阻滞并抑制PI3K-AKT-mTOR信号

RNA-seq分析显示,甘草查尔酮C处理后的下调基因显著富集于细胞周期和PI3K-AKT通路(图2B),上调基因富集于代谢通路(图2C)。流式细胞术证实其诱导G1期阻滞(图2D),Western blot显示Cyclin D1、CDK2、CDK4蛋白水平下调(图2E-F)。同时,PI3K、AKT和mTOR的磷酸化水平显著受抑(图2G-H),在类器官中亦得到验证(图2I),免疫荧光进一步显示p-AKT和p-mTOR表达降低(图2J-K)。这些结果表明甘草查尔酮C通过阻断G1/S转换和抑制PI3K-AKT-mTOR通路发挥抗肿瘤作用。

甘草查尔酮C处理后的细胞周期和PI3K-AKT-mTOR信号传导分析

图2.甘草查尔酮C处理后的细胞周期和PI3K-AKT-mTOR信号传导分析。



3. 甘草查尔酮C直接靶向RAC3并抑制其活性,但不改变其蛋白表达

为寻找直接靶点,研究者合成生物素标记的甘草查尔酮C,进行pull-down联合质谱分析(图3A),鉴定出多个候选蛋白,其中RAC3因已知可激活PI3K-AKT通路而被重点关注(图3B)。分子对接预测甘草查尔酮C与RAC3具有良好的结合亲和力(图3C-D)。CETSA实验表明,甘草查尔酮C处理增强RAC3的热稳定性(图3E-F),Co-IP证实生物素-甘草查尔酮C可结合内源性RAC3(图3G-H)。然而,甘草查尔酮C并不改变RAC3蛋白表达水平(图3I),但显著降低RAC3的GTPase活性(G-LISA实验,图3J),IC50分别为36.7 μM(AGS)和23.6 μM(MKN45)。综上,甘草查尔酮C是RAC3的直接抑制剂,通过结合RAC3抑制其功能而非下调其表达。

甘草查尔酮C的RAC3靶点验证

图3.甘草查尔酮C的RAC3靶点验证



4. RAC3功能调控胃癌细胞进展及PI3K-AKT-mTOR信号,并介导甘草查尔酮C的表型效应

构建RAC3敲低(shRNA)模型后,细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭均显著受抑(图4C-H),而RAC3过表达则增强这些恶性表型(图4K-O),且过表达可逆转甘草查尔酮C的抑制作用(补充图2)。机制上,RAC3敲低下调Cyclin D1/CDK2/CDK4并抑制PI3K/AKT/mTOR磷酸化(图4P-U),而过表达则相反(图4V-W)。这些结果证实RAC3是甘草查尔酮C发挥抗肿瘤效应的功能性靶点。

RAC3相关的细胞表型和PI3K-AKT-mTOR信号传导

图4、RAC3相关的细胞表型和PI3K-AKT-mTOR信号传导。



5. 临床分析显示RAC3在胃癌中过表达且与不良预后相关,RAC3敲低通过下调P-gp增强5-FU敏感性

TCGA和GSE66229数据集显示RAC3 mRNA在胃癌组织中显著高于正常组织(图5A-B)。三个独立GEO队列(GSE29272、GSE15459、GSE183136)的Kaplan-Meier分析表明高RAC3表达与较差总生存显著相关(图5C-E),TCGA中亦提示更差的特异性生存(图5F)。IHC验证了RAC3蛋白在胃癌组织中高表达,且与晚期临床分期正相关(图5G-K)。重要的是,RAC3敲低后,5-FU的IC50显著降低(图5N-O),同时P-gp(MDR1编码)蛋白表达下调,而MRP1/MRP2无明显变化(图5P-Q)。临床标本中,辅助化疗后复发患者的RAC3表达显著高于无复发生存者(图5L-M)。这些结果表明RAC3过表达是化疗耐药和不良预后的标志物,且RAC3通过上调P-gp介导耐药。

RAC3表达、预后及5-FU敏感性分析

图5、RAC3表达、预后及5-FU敏感性分析。



6. 甘草查尔酮C下调P-gp并增强5-FU在细胞、类器官及体内的敏感性

Western blot证实甘草查尔酮C处理显著降低P-gp表达(图6C),与RAC3敲低表型一致。在细胞系中,甘草查尔酮C联合5-FU使5-FU的IC50显著下降(图6A-B)。在患者来源类器官中,联合处理亦显著降低IC50(图6D-E)。体内裸鼠移植瘤模型中,单独使用甘草查尔酮C(低/高剂量)或5-FU均能抑制肿瘤生长,而联合治疗组(低剂量甘草查尔酮C+5-FU)显示出最强的抑瘤效应,表现为肿瘤体积最小、重量最轻(图6F-I),且Ki67增殖指数最低(图6J)。该体内实验证实甘草查尔酮C既能单药抗癌,又能有效增敏5-FU化疗。

甘草查尔酮C和5-FU在胃癌模型中的反应

图6、甘草查尔酮C和5-FU在胃癌模型中的反应。



整体机制模型


基于上述发现,研究者提出了甘草查尔酮C增强5-FU化疗敏感性的双重协同机制:

第一重:抑制RAC3-PI3K-AKT-mTOR-P-gp轴(直接增敏)

甘草查尔酮C直接结合RAC3并抑制其GTPase活性 → 阻断RAC3介导的PI3K-AKT-mTOR信号激活 → 下调P-gp(药物外排泵)表达 → 减少5-FU外排,增加胞内药物累积,增强细胞毒性。

第二重:抑制RAC3-细胞周期进程(协同增效)

甘草查尔酮C抑制RAC3后,PI3K-AKT-mTOR通路受抑 → 下调Cyclin D1/CDK2/CDK4 → 诱导G1期阻滞 → 减缓肿瘤细胞增殖,使更多细胞处于5-FU敏感周期(S期),从而增强5-FU的杀伤效应。

两条通路共同作用:一方面提高5-FU胞内浓度,另一方面使细胞更易受药物攻击,两者协同显著抑制胃癌进展。该研究首次揭示RAC3作为胃癌化疗敏感性调控的关键节点,并将甘草查尔酮C定位为靶向RAC3的天然增敏剂,为临床联合治疗提供了坚实的理论基础和实验依据。




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