双序列密码子比对工具
双序列密码子比对工具能够用最优化的方式比对两个序列。比对所用的打分矩阵来自于
Schneider et al. (2005)
。此双序列密码子比对工具用于查找保守编码区。只允许ACGTU作为合法碱基字符。
输入原始序列或者FASTA格式序列，长度限定在6000以内。
>sequence one atgtttcagaaagaggatcttgctacatggatgcaaatttcaatgagtggtcaatttgatgatacagcattagaggaatggagtacaaatggtaaagaacctgagatctgtgagaaatctccaaaagctgatggagttactacgattatggagagagctctatgtccatgggatagcagagtcaactaccaagagagccgagaacctaaattgattgctgaatcagtttgtctatgccgtaagagccgtggttctacaggagctttctgtatgccaattgttcgaaaagttccaattctccgacgtgtctcttgtgatcgttcaacaggtttatggaattatgtaagatcaactgagctaataactgttggatgtcattctgtattgccaagaactcaaagagcagcacgtcttgcccatttatcatcttctcgtattattgtttaa
输入原始序列或者FASTA格式序列，长度限定在6000以内。
>sequence two caggttacaattggagccatttcatcttctgactgaggaaatcaggtccgacagcgtagatgtatacacgctctattcacaaaattggtaacgattctg
配置打分规则
*序列前有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
*序列中间有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
*序列后有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
分
* 此工具需要浏览器支持JavaScript. 详情请见
浏览器兼容性介绍.
* 您可以
镜像此工具到自己的网站
or也可以单机使用