表达载体通用测序引物

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表达载体通用测序引物

在我们的实验中,载体构建完成后需要对质粒进行验证,验证我们的目的基因是否正确连入载体,我们以目的基因的序列设计引物,可以准确的测得目的基因连入载体的情况,但是如果待测序质粒非常多,针对每个目的基因设计引物并合成引物,成本会非常高,因此,我们可以根据载体上的序列设计通用引物,以便于测序所有连入该载体的基因。

本文根据常用质粒的通用原件序列,汇总了各种类型的质粒的通用测序引物序列

载体类型 引物序列(5’到3’)
哺乳表达载体CMV启动子型 (F-primer) CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG
哺乳表达载体U6启动子型 (F-primer) GACTATCATATGCTTACCGT
含荧光素酶报告基因 (F-primer) AGTCAAGTAACAACCGCGA
M13 (F-primer) CAGGAAACAGCTATGAC
M13 (R-primer) CAGGAAACAGCTATGAC
MSCV 哺乳动物细胞逆病毒基因表达载体 (F-primer) CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC
pGEX 载体 (F-primer) GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG
含SP6启动子的载体 (F-primer) ATTTAGGTGACACTATAG
含T3启动子的载体 (F-primer) GCAATTAACCCTCACTAAAGG
含T7启动子的载体 (F-primer) TAATACGACTCACTATAGGG
含AOX启动子的载体5’AOX1 (F-primer) GACTGGTTCCAATTGACAAGC
含35S 启动子载体 (F-primer) CTATCCTTCGCAAGACCCTTC
含果蝇肌动蛋白5C启动子载体 (F-primer) ACACAAAGCCGCTCCATCAG
含Alpha-factor信号肽载体 (F-primer) TACTATTGCCAGCATTGCTGC
氨苄抗性基因5’端序列 (R-primer) ATAATACCGCGCCACATAGC
含AUG1 启动子的毕赤酵母表达载体 (F-primer) CAATTTACATCTTTATTTATTAACG
含AUG1 启动子的毕赤酵母表达载体 (R-primer) GAAGAGAAAAACATTAGTTGGC
含BGH 转录终止子 (R-primer) TAGAAGGCACAGTCGAGG
含兔β-珠蛋白内含子载体 (F-primer) CTGGTCATCATCCTGCCTTT
含兔β-珠蛋白内含子载体 TTTGCCCCCTCCATATAACA
兔β-珠蛋白内含子多聚A区域引物 (R-primer) TTTTGGCAGAGGGAAAAAGA
氯霉素抗性基因的5'端序列 (R-primer) GCAACTGACTGAAATGCCTC
CRE重组酶5'端序列 (R-primer) GCAAACGGACAGAAGCATTT
含CYC1载体 (R-primer) GCGTGAATGTAAGCGTGAC
DsRed1 3'端序列 (F-primer) AGCTGGACATCACCTCCCACAACG
DsRed1 5'端序列 (R-primer) GTACTGGAACTGGGGGGACAG
含SV40 polyA terminator载体 (R-primer) GTGGTTTGTCCAAACTCATC
果蝇热休克启动子 (F-primer) CTCTGAATACTTTCAACAAGTTAC
哺乳体系含EF-1a启动子载体 (F-primer) TCAAGCCTCAGACAGTGGTTC
EGFP 3'端序列 (F-primer) CATGGTCCTGCTGGAGTTCGTG
EGFP 5'端序列 (R-primer) CGTCGCCGTCCAGCTCGACCAG
含EXFP质粒 (R-primer) GTCTTGTAGTTGCCGTCGTC
含F1 origin质粒 (F-primer) GTGGACTCTTGTTCCAAACTGG
含GAL1启动子载体 (F-primer) AATATACCTCTATACTTTAACGTC
含GaL 10启动子载体 (F-primer) GGTGGTAATGCCATGTAATATG
Gal4 DNA结合域3'端序列 (F-primer) GAGTAGTAACAAAGGTCAA
Gal4 DNA激活域3'端序列 (F-primer) AATACCACTACAATGGAT
GFP 3'端序列 (F-primer) GGTCCTTCTTGAGTTTGTAAC
GFP 5'端序列 (F-primer) CCATCTAATTCAACAAGAATTGGGACAAC
含GPD 启动子载体 (F-primer) CGGTAGGTATTGATTGTAATTCTG
Gateway cassette 3'端序列 (F-primer) GCATGATGACCACCGATATG
Gateway cassette 5'端序列 (R-primer) AATCTCGCCGGATCCTAACT
哺乳体系载体H1启动子型 TCGCTATGTGTTCTGGGAAA
HA标签 (F-primer) TACCCATACGACGTCCCAGA
HA标签 (R-primer) TCTGGGACGTCGTATGGGTA
HAT标签 (F-primer) GAGGAGCACGCTCATGCCCAC
含hGH终止子载体 (R-primer) CCAGCTTGGTTCCCAATAGA
含hrGFP载体 (F-primer) TCCCCGAGTACCACTTCATC
含hUBC启动子 (F-primer) TGAAGCTCCGGTTTTGAACT
IRES 3'端序列 (F-primer) TGGCTCTCCTCAAGCGTATT
IRES 5'端序列 (R-primer) CCTCACATTGCCAAAAGACG
L4440 载体5'端多克隆位点序列 (F-primer) AGCGAGTCAGTGAGCGAG (Caldwell lab) 5' of MCS in L4440 vector, forward primer
LacI 5'端序列 (R-primer) GGCATACTCTGCGACATCGT
LacZ 5'端序列 (R-primer) GACAGTATCGGCCTCAGGAA
LexA DNA结合域3'端序列 (F-primer) CGTCAGCAGAGCTTCACCATTG (Caldwell lab)
哺乳体系载体CMV启动子型 (F-primer) AGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATC
Luc 3'端序列 (F-primer) AGTCAAGTAACAACCGCGA
Luc 5'端序列 (R-primer) CCTTATGCAGTTGCTCTCC
M13 (-21) (F-primer) TGTAAAACGACGGCCAGT
M13 (-40) GTTTTCCCAGTCACGAC
M13/pUC (F-primer) CCCAGTCACGACGTTGTAAAACG
M13/pUC (R-primer) AGCGGATAACAATTTCACACAGG
MBP 3’端序列 (F-primer) GATGAAGCCCTGAAAGACGCGCAG (Waugh lab)
mCherry 3’端序列 (F-primer) CCCCGTAATGCAGAAGAAGA
mCherry 5’端序列 (R-primer) TTGGTCACCTTCAGCTTGG
果蝇金属硫蛋白启动子 (F-primer) CATCTCAGTGCAACTAAA
MMLV (F-primer) ATCAGTTCGCTTCTCGCTTC
mPGK启动子 (F-primer) CATTCTGCACGCTTCAAAAG
MSCV (F-primer) CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC
MSCV (R-primer) CAGCGGGGCTGCTAAAGCGCATGC
MT1 (F-primer) GCTGTCCTCTAAGCGTCACC
mU6启动子 (F-primer) CAGCACAAAAGGAAACTCACC
Myc (F-primer) GCATCAATGCAGAAGCTGATCTCA
Neo 3'端序列 (F-primer) CGTTGGCTACCCGTGATATT
Neo 5'端序列 (R-primer) GCCCAGTCATAGCCGAATAG
含NOS启动子载体 (F-primer) GCGTTCAAAAGTCGCCTAAG
含Nmt1启动子载体 (F-primer) GCAATGTGCAGCGAAACTAA
含OpIE2 启动子载体 CGCAACGATCTGGTAAACAC
含p15A origin载体 (F-primer) TGAAGTCAGCCCCATACGAT
pAd-CMV载体SalI限制酶位点后序列 GCTAGAGATCTGGTACCGTC
pBABE载体多克隆位点3'端的SV40  enhancer引物 (R-primer) ACCCTAACTGACACACATTCC (Weinberg Lab) SV40 enhancer, 3' of MCS in pBABE vectors, reverse primer
pBABE载体多克隆位点5'端Psi packaging signal引物 CTTTATCCAGCCCTCAC
含大肠杆菌araBAD 启动子载体 (F-primer) ATGCCATAGCATTTTTATCC
含大肠杆菌araBAD 启动子载体 (R-primer) GATTTAATCTGTATCAGG
pBluescript载体 (F-primer) TCGAGGTCGACGGTATC
pBluescript载体 (F-primer) TCTAGAACTAGTGGATC
pBMN 载体 MMLV序列 GCTTGGATACACGCCGC
pBR322 载体的ori引物 (F-primer) GGGAAACGCCTGGTATCTTT
pBR322载体BamHI位点上游序列 (F-primer) CTTGGAGCCACTATCGAC
pBR322载体EcoRI位点上游序列 (F-primer) AATAGGCGTATCACGAGGC
pBR322载体BamHI位点下游序列 (R-primer) GGTGATGTCGGCGATATAGG
pCAG载体兔β-珠蛋白内含子引物 (F-primer) GCAACGTGCTGGTTATTGTG
pCasper载体果蝇微白基因引物 (R-primer) GGGTTTTATTAACTTACAT
pCasper载体Hsp70启动子引物 (F-primer) GCAACTACTGAAATCTGCCAAG Drosophila Hsp70 promoter, forward primer
pcDL载体EcoRI位点5’端 (F-primer) GTTGCCTTTACTTCTAGGCCT
pENTR载体的attL1 5’端 (F-primer) CTACAAACTCTTCCTGTTAGTTAG
pENTR载体的attL2 3’端 (R-primer) ATGGCTCATAACACCCCTTG
pGEX 载体多克隆位点的3'端序列 (R-primer) CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG
pGEX 载体glutathione-S-transferase 3’端序列 (F-primer) GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG
pGP704载体R6K gamma origin引物 (R-primer) AACAAGCCAGGGATGTAACG
pHybLex 载体ADH terminator引物 (R-primer) GAGTCACTTTAAAATTTGTATACAC
pL启动子载体 (F-primer) ACTGAGCACATCAGCAGGAC
pLXSN 载体 (F-primer) CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC
pMT2载体 (F-primer) TTGCCTTTCTCTCCACAGGT
pMX-S1811载体的MMLV序列 (F-primer) GACGGCATCGCAGCTTGGATACAC
含Polyhedrin 启动子载体 (F-primer) AAATGATAACCATCTCGC
含Polyhedrin 启动子载体 (R-primer) GTCCAAGTTTCCCTG
pQE 载体 (F-primer) CCCGAAAAGTGCCACCTG
pREP 载体 (F-primer) GCTCGATACAATAAACGCC
pRS载体的酵母选择标记序列 CGGCATCAGAGCAGATTGTA
PZ P-element (R-primer) CTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAAT
pTrcHis 载体 (F-primer) GAGGTATATATTAATGTATCG
pTrcHis 载体 (R-primer) GATTTAATCTGTATCAGG
嘌呤霉素3’端基因序列 (F-primer) GCAACCTCCCCTTCTACGAGC
pZIP载体 (R-primer) TCCTTTCCAGCGAGGTTCTA
RSV基因3’端序列 (F-primer) ACATGGGTGGTGGTATAGCGCTTGCG
海肾荧光素酶基因3’端序列 (F-primer) CCAGGATTCTTTTCCAATGC
pGL3 载体 (F-primer) CTAGCAAAATAGGCTGTCCC
SP6启动子载体 (F-primer) ATTTAGGTGACACTATAG
SV40 polyA引物 (R-primer) GAAATTTGTGATGCTATTGC
SV40启动子载体 (F-primer) TATTTATGCAGAGGCCGAGG
SV40-splice序列 (R-primer) CACAAAGATCCGGACCAAAG
T7 终止子引物 (R-primer) GCTAGTTATTGCTCAGCGG
Tac 启动子载体 GAGCGGATAACAATTTCACACAGG
tdTomato 3’端序列 (F-primer) CTGTTCCTGTACGGCATGG
tdTomato 5’端序列 (R-primer) TCTTTGATGACGGCCATGT
四环素抗性基因5’端序列 (R-primer) GGCGAGTTTACGGGTTGTTA
Thymidine kinase polyA引物 (R-primer) TTGTCTCCTTCCGTGTTTCA
Tn7转座子引物 GGGGTGGAAATGGAGTTTTT
哺乳体系载体含U6启动子型 (F-primer) CAAGGCTGTTAGAGAGATAATTGGA
Ubx基因引物 (F-primer) AACTCGTACTTTGAACAGGC
V5 表位基因引物 (R-primer) ACCGAGGAGAGGGTTAGGGAT
WPRE 5’端引物 (R-primer) CATAGCGTAAAAGGAGCAACA
XBG 3'UTR (R-primer) GACTCCATTCGGGTGTTC
XEF1a增强子/启动子引物 (F-primer) TTTCGCCCTAACTTCGTGAT